Wiązania peptydowe mają konfigurację płaską, trans, i podlegają bardzo małej rotacji lub skręcaniu wokół wiązania amidowego, które łączy azot α-aminowy jednego aminokwasu z węglem karbonylowym następnego (Rysunek 4-1).
Dlaczego rotacja wokół wiązania peptydowego jest zabroniona?
Dlaczego rotacja dotycząca wiązania peptydowego jest zabroniona i jakie są konsekwencje braku rotacji? Wiązanie peptydowe ma charakter częściowego wiązania podwójnego, co zapobiega rotacji. Ten brak rotacji ogranicza konformacje szkieletu peptydowego i ogranicza możliwe struktury.
Czy wiązania peptydowe mogą się wyginać?
Ponieważ szkielet polipeptydu, utrzymywany razem przez wiązania peptydowe, jest elastyczny (ze względu na „rotację wokół wszystkich tych wiązań”), łańcuch może się zginać, skręcać, i dopasowuj się do bardzo szerokiej gamy trójwymiarowych kształtów.
Czy wiązania peptydowe są odwracalne?
Chociaż wiązanie peptydowe można odwrócić przez dodanie wody (hydroliza), wiązania amidowe są bardzo stabilne w wodzie o neutralnym pH, a hydroliza wiązań peptydowych w komórkach jest również kontrolowany enzymatycznie.
Czy wiązania peptydowe mają kierunkowość?
Mimo że geometria grupy peptydowej jest ustalona, wiązania po obu stronach węgli alfa mogą się obracać. Pozwala to na elastyczność w szkielecie peptydowym. … Sekwencja aminokwasów w białku ma kierunkowość luborientacja określona przez grupy funkcyjne na końcach łańcucha.
