W biologii molekularnej STRING (Narzędzie wyszukiwania interakcji między genami/białkami) jest biologiczną bazą danych i internetowym źródłem znanych i przewidywanych interakcji białko-białko. … Najnowsza wersja 11b zawiera informacje o około 24,5 milionach białek z ponad 5000 organizmów.
Do czego służy baza danych STRING?
Baza danych STRING ma na celu zbieranie i integrowanie tych informacji poprzez konsolidację znanych i przewidywanych białek–dane asocjacji białek dla dużej liczby organizmów.
Co to jest wynik STRING?
W STRING każda interakcja białko-białko jest opisana jednym lub więcej „wynikami”. Co ważne, te wyniki nie wskazują na siłę ani specyfikę interakcji. Zamiast tego są wskaźnikiem zaufania, tj. jak prawdopodobne jest, że STRING oceni interakcję jako prawdziwą, biorąc pod uwagę dostępne dowody.
Dlaczego białka wchodzą w interakcje?
Interakcje białko-białko (PPI) to fizyczne kontakty o wysokiej specyficzności ustanowione między dwiema lub więcej cząsteczkami białka w wyniku zdarzeń biochemicznych sterowanych przez interakcje, które obejmują siły elektrostatyczne, wodór wiązanie i efekt hydrofobowy.
Co to jest powiązanie funkcjonalne?
definicja. Binarny związek między jednostkami biologicznymi gdy jeden z nich moduluje drugi pod względem funkcji, ekspresji, degradacji lub stabilności drugiego i relacjimiędzy partnerami nie można ustalić jako bezpośrednie, więc pośrednie kroki są domyślnie obecne.