Przez wychwytywanie konformacji chromosomów?

Spisu treści:

Przez wychwytywanie konformacji chromosomów?
Przez wychwytywanie konformacji chromosomów?
Anonim

Metody oparte na wychwytywaniu konformacji chromosomów (3C) ujawniają organizację chromosomów w jądrze poprzez określenie fizycznej bliskości par punktów wzdłuż chromatyny. Zachowują interakcje z chromatyną poprzez sieciowanie, a następnie fragmentację, ligację i sekwencjonowanie oddziałujących regionów.

Jak działa przechwytywanie konformacji chromosomów?

Przechwytywanie konformacji chromosomów na chipie (4C) wychwytuje interakcje między jednym locus a wszystkimi innymi loci genomowymi. Obejmuje to drugi etap ligacji, w celu stworzenia samo-cyrkularnych fragmentów DNA, które są wykorzystywane do przeprowadzenia odwrotnej reakcji PCR. … Na jednej mikromacierzy można przeanalizować około miliona interakcji.

Co to jest wychwytywanie konformacji chromatyny?

Chromatin Conformation Capture (3C) jest ważną techniką wykorzystywaną do badania struktury chromatyny, a także podstawą kilku innych technik pochodnych. … Protokół obejmuje sieciowanie komórek formaldehydem, a następnie izolację chromatyny i trawienie enzymem restrykcyjnym.

Jak działa sekwencjonowanie Hi-C?

Podejście Hi-C rozszerza 3C-Seq do mapowania kontaktów chromatyny w całym genomie, a także zostało zastosowane do badania interakcji chromatyny in situ. W tej metodzie kompleksy DNA-białko są sieciowane formaldehydem. Próbka jest fragmentowana, a DNA jest ekstrahowane, ligowane i trawione enzymami restrykcyjnymi.

Co to jest technika Hi-C?

Klasyczna technika Hi-C obejmuje trawienie restrykcyjne usieciowanego formaldehydem genomu za pomocą enzymów restrykcyjnych specyficznych dla sekwencji, po którym następuje wypełnienie i naprawa strawionych końców z włączeniem nukleotydy połączone z biotyną. Naprawione końce są następnie ponownie ligowane.

Zalecana:

Interesujące artykuły
Co oznacza „sitrep” w wojsku?
Czytaj więcej

Co oznacza „sitrep” w wojsku?

: okresowy raport o aktualnej sytuacji wojskowej. Ile linii jest w jednym miejscu? 21 linii. jest używany głównie na poziomie batalionu i wyższym, aby aktualizować i informować kadrę dowódczą wyższego i niższego szczebla o krytycznej sytuacji zgłaszającego dowódcę.

W którym miejscu spotykają się ganga i brahmaputra?
Czytaj więcej

W którym miejscu spotykają się ganga i brahmaputra?

Sundarbans to miejsce, w którym spotykają się rzeki Ganga i Brahmaputra. Kiedy Ganga spotyka się z Brahmaputrą w Bangladeszu? Nazywa się Jamuna w Bangladeszu. Tutaj Tista i inne rzeki spotykają Brahmaputrę, która w końcu wpada do Padmy (Ganga).

W jądrzastych krwinkach czerwonych?
Czytaj więcej

W jądrzastych krwinkach czerwonych?

RBC jądrzaste to czerwone krwinki z jądrem. Jądro zawierające DNA powinno wysunąć się naturalnie, gdy komórka rozwija się w szpiku kostnym. Kiedy jądro się rozpuści, komórka staje się bardziej elastyczna. Wyciska się z iluminatorów w szpiku kostnym i dostaje się do krwiobiegu.